The Adaptation of Silica Capture RT-PCR for the Detection of Potato Virus YReportar como inadecuado




The Adaptation of Silica Capture RT-PCR for the Detection of Potato Virus Y - Descarga este documento en PDF. Documentación en PDF para descargar gratis. Disponible también para leer online.

American Journal of Potato Research

, Volume 91, Issue 5, pp 525–531

First Online: 08 March 2014

Abstract

In Poland, it is mandatory to index seed tubers for Potato virus Y PVY, Potato virus M PVM and Potato leafroll virus PLRV. Currently, the incidence of viral infection in seed tubers is determined by grow-out test. Direct testing of tubers after harvest by reverse transcription polymerase chain reaction RT-PCR can be beneficial but its application is so far hampered by the high cost of commercial kits for RNA isolation and poor usability of manual methods for routine diagnostics. In this work, we compare several commercial kits with the silica capture RT-PCR SC-RT-PCR for direct detection of PVY. The silica capture of RNA in conjunction with optimized PCR conditions facilitates quick and sensitive detection of PVY and offers cost effective and reliable alternative to commercial kits.

KeywordsPotato virus Y Silica capture RNA extraction RT-PCR Resumen

En Polonia, los tubérculos-semilla son analizados obligatoriamente para el virus Y de la papa PVY, virus M de la papa PVM y el enrollamiento de la hoja PLRV. Actualmente, la incidencia de infección viral en tubérculo-semilla se determina por pruebas durante el crecimiento. Las pruebas directas de tubérculos después de la cosecha con la reverso-transcripción por la reacción en cadena de la polimerasa RT-PCR pudiera ser benéfica, pero su aplicación se limita por el alto costo de juegos comerciales para el aislamiento de ARN y por el pobre uso de métodos manuales para diagnósticos de rutina. En este trabajo comparamos varios juegos comerciales con la efectividad de costos de captura de sílice RT-PCR para detección directa de PVY. La sensibilidad en la detección del PVY en ARN preparado por captura de sílice fue igual o mayor que en ARN aislado usando juegos comerciales. El ARN por captura de sílice junto con condiciones óptimas de PCR facilita la detección rápida y sensible de PVY y ofrece una alternativa efectiva, en costos y confiabilidad, a los juegos comerciales.

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Autor: Bogumiła Zacharzewska - Agnieszka Przewodowska - Krzysztof Treder

Fuente: https://link.springer.com/







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